Согласно современным представлениям, человеческий организм является голобионтом, т. е. представляет собой содружество клеток самого организма и всех микробов, населяющих различные органы и ткани. Микробы могут быть как постоянными, так и транзиторными. В 2007 г. начат проект изучения микробиома человека (Human Microbiome Project), цель которого — создание полного каталога обнаруженных в человеческом организме бактерий и последовательности их ДНК [1]. В дальнейшем работа по проекту микробиома человека расширена путем изучения состава микробов при различных патологических состояниях и заболеваниях, таких как преждевременные роды, болезнь Крона, сахарный диабет 2-го типа и т. д. [2].

Поскольку культивирование многих микроорганизмов затруднено, и методы диагностики с помощью различных вариантов полимеразной цепной реакции (ПЦР) предполагают наличие видоспецифичных праймеров, разработана технология универсальной диагностики ДНК микроорганизмов с перспективой тахономического анализа. Данная технология основана на наличии в геноме микробов гена, кодирующего 16S рибосомальную РНК (16S rRNA). Этот ген содержит 9 гипервариабельных областей, которые помогают точно идентифицировать ДНК различных микроорганизмов и классифицировать их, а также открывать новые виды бактерий, которые никогда не выделялись в культуре. Этот метод включает массово параллельное секвенирование (секвенирование нового поколения, NGS) гена16S rRNA и биоинформационный анализ полученных данных с классификацией ДНК по таксономическим единицам [3]. Следует отметить, что необходимо различать следующие термины: микробиота — это сообщество микроорганизмов, живущих в определенном регионе, и микробиом — это результаты исследования ДНК микробов определенного региона с распределением по тахономическим группам.

Метагеномикой называется анализ генетического материала, извлеченного непосредственно из проб окружающей среды. Этот анализ позволяет определять такие таксономические группы, как тип, класс, порядок, семейство, род и вид микроорганизмов. Применяется также индекс видового разнообразия Симпсона, который в микробиологии отражает разнообразие видов бактерий в изученной популяции. При диагностике бактериального вагиноза используют микроскопию и подсчет так называемого критерия Нугента. Этот метод основан на подсчете числа грамотрицательных и грамположительных бактерий и их размера. При низком значении критерия Нугента (0—3 балла) предполагается отсутствие бактериального вагиноза; при числе 4—6 баллов можно предполагать переходное состояние и при числе 7 баллов и более устанавливают диагноз — бактериальный вагиноз.

При исследовании микробиома следует уточнить понятие биопленки. Под этим термином следует понимать структуру, которую образуют бактерии, схожую с многоклеточным организмом, и эта структура позволяет микробам переживать вредное воздействие окружающих факторов и даже приобретать устойчивость к антибиотикам.

Исследование микробиома репродуктивного тракта человека показало преемственность сообщества микробов от семенной жидкости до микробиомов влагалища матки, маточных труб и даже кишечного тракта новорожденных.

Проведенный анализ микробиоты семенной жидкости 19 доноров спермы, 10 пациентов с астенозооспермией, 23 пациентов с умеренной олигоастенозооспермией и 25 пациентов с выраженной формой олигоастенозооспермии и азооспермией показал большое разнообразие видов бактерий. В основном представлены бактерии родов Ralstonia, Lactobacillus, Corynebacterium, Streptococcus, Staphylococcus, Prevotella, Finegoldia, Anaerococcus, Peptoniphilus, incertae sedis XI (семейство), Veillonella, Pelomonas, Porphyromonas, Acidovorax, Atopobium, Ureaplasma, Bradyrhizobium, Aerococcus, Gemella, Granulicatella, Clostridiales и Cloacibacterium. Из них условно-патогенными считаются бактерии родов Ralstonia, Prevotella, Finegoldia, Anaerococcus, Peptoniphilus, Gemella, Granulicatella, Clostridiales, Pelomonas, Porphyromonas, Acidovorax и Cloacibacterium. Бактерии, относящиеся к порядку Clostridiales, являются анаэробами, ассоциированными с бактериальным вагинозом. Многие бактерии, описанные в этом исследовании, обнаружены также на коже полового члена и в уретре. При сравнительном исследовании микробиоты семенной жидкости доноров и пациентов с различной выраженностью мужского бесплодия выявлено большое сходство представленных сообществ бактерий. Единственной группой бактерий, которая ассоциировалась с плохим качеством спермы, был род Anaerococcus [4]. В другом исследовании предпринята попытка проанализировать связь между показателями спермограммы и сообществами микробов в сперме 96 мужчин, обратившихся в клинику лечения бесплодия. Выяснено, что в сперме наиболее многочисленными были бактерии, принадлежащие к родам Lactobacillus (19,9%), Pseudomonas (9,85%), Prevotella (8,51%) и Gardnerella (4,21%). При нормальных показателях спермы была значительно выше доля Lactobacillus и Gardnerella, в то время как в образцах с низкими показателями спермограммы — доля Prevotella. Описано три типа бактериальных сообществ с преобладанием микробов родов Lactobacillus, Pseudomonas и Prevotella соответственно. Подавляющее большинство (80,6%) нормальных образцов ассоциированы с сообществом с преобладанием рода Lactobacillus. Авторы предположили, что пробиотики на основе бактерий рода Lactobacillus могут быть использованы для подавления роста бактерий родов Pseudomonas и Prevotella в целях улучшения качества спермы [5].

При исследовании микробиома спермы у 21 пациента с хроническим простатитом и у 46 здоровых мужчин выявлены статистически значимые различия. Так, у здоровых мужчин было выше количество бактерий рода Lactobacillus по сравнению с пациентами с хроническим простатитом, 27% по сравнению с 20,2%, р=0,05. Наиболее выраженными были различия по виду Lactobacillus iners. Бактерии типа Proteobacteria чаще встречались у пациентов с хроническим простатитом. Более того, у этих пациентов наблюдалось большее разнообразие бактерий. Индекс видового разнообразия Симпсона у пациентов с простатитом составил 13,5±5,8, у здоровых мужчин — 10,3±4 [6].

У 23 супружеских пар исследован микробиом спермы и проведено сравнение с микробиомом влагалища до и после полового акта. Показано, что сообщества бактерий в сперме были значительно разнообразнее, но с более низкими общими бактериальными концентрациями, чем во влагалище. Выявлена четкая ассоциация между преобладанием у женщин во влагалище вида Gardnerella vaginalis и наличием у полового партнера лейкоцитоспермии. Наблюдалось значительное уменьшение относительной численности Lactobacillus crispatus после полового акта и увеличение соответствия в микробиоме между спермой и вагинальными образцами [7].

Особый интерес вызывает проблема бактериального вагиноза, ассоциированного с повышенной вероятностью заражения заболеваниями, передающимися половым путем (сифилис, гонорея, хламидиоз и ВИЧ). Эпидемиологические исследования показывают, что бактериальный вагиноз может передаваться половым путем, хотя точный инфекционный агент не выявлен. Данное заболевание обычно рассматривают как дисбиоз. Предпринята попытка изучить микробиом половых партнеров женщин, страдающих бактериальным вагинозом. С этой целью обследованы моногамные пары. У 65 женщин выявлен бактериальный вагиноз, у 31 женщины этого заболевания не было. Изучены микробиомы влагалища, а также уретры и кожи полового члена партнера. Выявлено строгое сходство между микробиомом влагалища пациенток, страдающих бактериальным вагинозом, и микробиомом уретры и кожи полового члена партнера. В то же время у здоровых пар такого сходства не выявлено. У здоровых женщин во влагалище подавляющими видами были Lactobacillus iners и Lactobacillus crispatus, что, вероятно, подавляло рост других видов микробов. Это исследование подтверждает теорию о бактериальном вагинозе как о дисбиозе, который может передаваться половым путем [8]. Добавление пробиотиков Lactobacillus brevis CD2, Lactobacillus plantarum FV9 и Lactobacillus salivarius FV2, которые эффективны при лечении бактериального вагиноза, позволяет длительно сохранять подвижность сперматозоидов в культуре и спасает от вредоносного воздействия других микробов [9].

Наиболее изученным микробиомом репродуктивной системы женщины является микробиом влагалища. Хорошо известно, что в норме во влагалище доминируют бактерии рода Lactobacillus. Из большого числа близкородственных видов лактобацилл во влагалище доминируют лактобациллы L. crispatus, L. gasseri, L.iners и L.jensenii. В то же время такие распространенные в природе виды, как L. helveticus и L. acidiphilus, не колонизируют влагалище. Это говорит о том, что существует механизм взаимодействия между гормонозависимым эпителием влагалища и заселением лактобацилл только определенных видов [10].

Еще одним интересным аспектом являются возрастные изменения микробиома влагалища у женщин. В течение перинатального периода под воздействием материнских эстрогенов происходит утолщение вагинального эпителия и откладывание гликогена с заселением микробов, способных метаболизировать глюкозу. После рождения происходит падение уровня эстрогенов, утончение эпителия влагалища девочки и изменение микробиома [11]. В детский период влагалище заселяют аэробные и факультативные анаэробные бактерии, грамотрицательные анаэробы, включая роды Actinomyces, Bifidobacterium, Peptococcus, Peptostreptococcus, Propionibacterium, и некоторые аэробные бактерии — Staphylococcus aureus, Staphylococccus epidermidis, Streptococcus viridans и Enterococcus faecalis. Лактобациллы, Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia встречаются редко [12]. У девочек-подростков при увеличении в крови уровня эстрогенов эпителий влагалища вновь утолщается и начинает производить гликоген, что приводит к заселению 4 ведущих видов лактобацилл; микробиом девушек в постпубертатном периоде не отличается от такового у взрослых женщин [13].

С падением эстрогенов в перименопаузальный период меняется и микробиом влагалища, преимущественными видами становятся L. crispatus, L. iners, G. vaginalis, Prevotella и в меньшей мере Candida, Mobiluncus, Staphylococcus, Bifidobacterium и Gemella [14].

Человеческий организм может регулировать присутствие микробов определенных видов, и нарушение микробиома влагалища приводит к так называемому дисбиозу с развитием таких заболеваний, как бактериальный вагиноз и аэробный вагинит. Молочная кислота и перекись водорода, выделяемые лактобациллами, играют важнейшую роль в подавлении роста Chlamydia trachomatis, патогенных штаммов Escherichia coli, Neisseria gonorrhoeae и патогенных вирусов — вируса простого герпеса (HSV-2) и ВИЧ 1-го типа. Стоит отметить, что лактобацилы имеют комплекс факторов, препятствующих прикреплению патогенных микробов к стенке влагалища. К другим видам, которые представлены во влагалище здоровых женщин, относятся строго анаэробные бактерии — Atopobium, Dialister, Gardnerella, Megasphaera, Prevotella, Peptoniphilus [10].

В отличие от микробиома кишечника микробиом влагалища подвержен меньшему разнообразию у различных этнических групп. У 26,3% здоровых женщин во влагалище присутствует сообщество микробов с абсолютным доминированием L. crispatus. Это доминирование характеризуется высоким уровнем продукции эпителием влагалища молочной кислоты (рН примерно равен 4), стабильностью микрофлоры и высокой устойчивостью к бактериальной и вирусной инфекции. Отмечаются также низкая склонность к бактериальному вагинозу, доминирование L. iners и устойчивость к инфицированию G. vaginalis. Этот тип доминирования наиболее часто встречается у женщин европейского и азиатского происхождения. У 6,3% здоровых женщин отмечено доминирование L. gasseri, при этом уровень продукции молочной кислоты относительно низкий. Это доминирование достаточно стойкое, сопровождается уровнем рН, примерно равным 5, и также характеризуется высокой стабильностью микробиома; чаще встречается у женщин европейского и азиатского происхождения. У 5,3% женщин описано доминирование во влагалище L. jensenii. При этом уровень продукции молочной кислоты умеренный и уровень рН 4,7. Такой вариант доминирования также чаще встречается у женщин европейского и азиатского происхождения. У 34,1% здоровых женщин отмечается доминирование L. iners. Этот тип доминирования представляет собой переходную форму к бактериальному вагинозу, характеризуется средним уровнем продукции молочной кислоты и уровнем рН 4,4; часто встречаются виды микробов, характерные для бактериального вагиноза. В L. iners нередко отмечается активация таких защитных механизмов как CRISPR, наличие холестеролзависимого цитолизина, муцина и гликогенвизирующих ферментов. Этот тип доминирования также характерен для женщин европейского и азиатского происхождения. У 27% женщин в основном африканского и латиноамериканского происхождения отсутствует доминирование лактобацилл, отмечается большое разнообразие видов бактерий во влагалище, уровень рН 4—5. При микроскопии выявляется отсутствие бактериального вагиноза (низкое число баллов по индексу Нугента). Этот тип доминирования может встречаться у здоровых женщин или при переходе к бактериальному вагинозу.

Для бактериального вагиноза характерны выраженное присутствие факультативных и облигатных анаэробов, отсутствие или низкая продукция молочной кислоты, высокое число баллов по критерию Нугента, образование полимикробных биопленок с присутствием G. vaginalis, высокая вероятность инфекции патогенными микробами и вирусами [15]. Разрушение патогенных биопленок является одним из защитных механизмов, которыми обладают лактобациллы. Многие факультативно патогенные микроорганизмы, такие как G. vaginalis и A. vaginae, в отсутствие бактериального вагиноза представлены тонкими биопленками, тогда как при бактериальном вагинозе биопленки резко увеличиваются в толщине. Следует отметить, что биопленка может выделять свободно плавающие бактерии, и соотношение между биопленкой и свободно плавающими (планктоническими) бактериями может определять как выраженность бактериального вагиноза, так и перспективы успешного лечения и возможности рецидива [16].

Влияние бактериального вагиноза на результат вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ) исследован в ряде работ. Показано, что наличие дисбиоза встречается чаще у пациенток с бесплодием по сравнению со здоровой популяцией [17, 18]. Более того, выявлена четкая ассоциация между наличием видов G. vaginalis и A. vaginae, вызывающих бактериальный вагиноз, и частотой успеха экстракорпорального оплодотворения (ЭКО) [19]. С этими бактериями ассоциирована и частота самопроизвольного патологического прерывания беременности. Более того, лечение бактериального вагиноза до ЭКО может значительно увеличить частоту наступления беременности.

В одном из метаанализов показано, что наличие бактериального вагиноза выявлено у 16% группы пациенток, проходящих лечение методом ЭКО с процедурой интрацитоплазматической инъекции сперматозоида (ИКСИ), и в большинстве это были пациентки с трубно-перитонеальным фактором бесплодия. Наличие бактериального вагиноза увеличивало вероятность самопроизвольного патологического прерывания беременности в раннем сроке (ОР 1,68 при 95% ДИ от 1,23 до 2,29), не оказывало влияния на частоту наступления клинической беременности (ОР 0,93 при 95% ДИ от 0,75 до 1,15) и на частоту живорождений в программах ЭКО/ИКСИ (ОР=1,47при 95% ДИ от 0,96 до 1,57) [20].

Следует отметить, что доминирование лактобацилл в микробиоме влагалища является особенностью человека и не встречается у высших приматов. При сравнении микробиома влагалища женщин и самок желтого павиана, павиана анубис, шимпанзе, обезьяны-ревуна, лемура, мангобеи, краcного колобуса, а также верветок, живущих в неволе и в дикой природе, выяснено, что у человека доминируют бактерии L. crispatus, родов Morganella и Pseudomonas, в то время как у высших приматов разных видов — бактерии родов Sneathia, Anaerosphaera и Aerococcus. Более того, микробиом влагалища человека отличается меньшим разнообразием представленных видов бактерий. Эти различия могут быть объяснены особенностями размножения человека, связанными с большей продолжительностью беременности и повышенной возможностью травматизации при родах, которая обусловлена несоответствием диаметра головы плода и половых путей. Таким образом, доминирование лактобацилл во влагалище является уникальным защитным механизмом организма человека [21].

Долгое время считалось, что в норме полость матки стерильна, однако исследования последних лет опровергли это утверждение. Начиная с 2016 г. опубликованы результаты ряда исследований, в которых изучен микробиом матки у здоровых женщин, при различных патологических состояниях и при применении технологий ВРТ. При анализе микробиома внутреннего кончика катетера после переноса эмбрионов в полость матки у 33 пациенток выявлено, что доминирующими являются микробы рода Lactobacillus, второй по значению популяцией являются микробы рода Flavobacterium. Не выявлено различий между микробиомами в случаях имплантации и в отсутствие таковой [22]. При исследовании микробиома матки у 19 пациенток с предыдущими неудачами имплантации при попытках ЭКО/ИКСИ и/или привычном невынашивании беременности использована биопсия эндометрия. Чаще всего встречались бактерии типа Bacteroidetes, видов Bacteroides xylanisolvens, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides fragilis. Вторыми по частоте выявления были бактерии типа Proteobacteria, которые включали бактерии рода Pelomonas и бактерии, родственные Escherichia/Schigella. У 6 пациенток в значительном количестве представлены лактобациллы — L. crispatus и L. iners [23]. Различия в микробиоме полости матки при исследовании мазка изучены у 30 пациенток, из которых 10 — здоровые женщины, у 10 выявлены полипы эндометрия, и у 10 полипы эндометрия сочетались с хроническим эндометритом. Чаще всего у здоровых женщин встречались бактерии типов Proteobacteria (73%), Firmicutes (14%) и Actinobacteria (5%), на уровне родов Enterobacter (33%), Pseudomonas (24%) и Lactobacillus (6%). У пациенток с полипами эндометрия и при сочетании полипов эндометрия с хроническим эндометритом наблюдалась большая пропорция бактерий типа Firmicutes. Более того, у пациенток с полипами эндометрия и хроническим эндометритом чаще встречались бактерии рода Prevotella и реже бактерии родов Enterobacter и Sphingomonas, чем у пациенток других исследованных групп [24]. Влияние эндометриоза на микробиом полости матки исследовано у 32 пациенток с этим заболеванием, 16 из которых получали лечение препаратами агонистов гонадотропин-рилизинг-гормона (ГнРГ). В качестве контрольной группы обследованы 32 женщины с доказанной фертильностью, 16 из которых получали препараты агонистов ГнРГ по поводу миомы матки. Исследован аспират из полости матки, найдено, что основные микробы в матке принадлежат к семействам Lactobacillacae, Streptococcaceae, Staphylococcaceae, Enterobacteriaceae и Moraxellaceae. Присутствие лактобацилл снижено у пациенток с эндометриозом на фоне и без лечения агонистами ГнРГ. У женщин с эндометриозом также наблюдалось повышенное присутствие бактерий семейств Streptococcaceae, Staphylococcaceae, Enterobacteriaceae, по сравнению с фертильными женщинами. Кроме того, авторы [25] отметили повышение уровня колонизации бактериями матки в течение менструального цикла женщины.

С целью исследования в период окна имплантации микробиома матки и проверки его влияния на частоту имплантации в программах ЭКО/ИКСИ проведен анализ аспирата из полости матки пререцептивного (2 дня после пика лютеинизирующего гормона) и рецептивного (7 дней после пика лютеинизирующего гормона) эндометрия 22 фертильных женщин, а также 35 пациенток, проходящих лечение методом ЭКО/ИКСИ. Не найдено различий в составе микробиома пререцептивного и рецептивного эндометрия. Выяснилось, что в среднем в полости матки присутствуют бактерии следующих родов Lactobacillus (71,7%), Gardnerella (12,6%), Bifidobacterium (3,7%), Streptococcus (3,2%), Prevotella (0,9%). Авторы разделили найденные бактериальные сообщества на те, в которых доминировали лактобациллы (более 90% микробов представлены данным родом), и те, в которых лактобациллы не доминировали (менее 90%). При анализе результатов лечения методом ЭКО/ИКСИ выявлено, что у пациенток с доминированием лактобацилл в полости матки, по сравнению с пациентками без такого доминирования, наблюдается более высокая частота имплантации (60,7% по сравнению с 23,1%; р=0,02), клинической беременности (70,6% по сравнению с 33,3%; р=0,03) и живорождений (58,8% по сравнению с 6,7%; р=0,002). Таким образом, микробиом эндометрия может значительно влиять на вероятность успеха процедур ВРТ [26]. У 70 пациенток, проходящих лечение методом ЭКО/ИКСИ, изучен микробиом на кончике катетера после переноса эмбрионов в полость матки. У 33 пациенток лактобациллы представляли более 90% от всех микробов, у 50 пациенток — более 70%. Выявлены также бактерии рода Corynebacterium у 40 пациенток, Staphylococcus и Streptococcus у 38 пациенток и Bifidobacterium у 15 пациенток [27].

Проведено исследование микробиома полости матки и влагалища у 102 пациенток с бесплодием (79 женщин, проходящих лечение методом ЭКО, и 23, у которых метод ЭКО не применяли) и у 7 здоровых женщин. Выявлено, что доминирование Lactobacillus spp. (более 90% от всех микроорганизмов) наблюдалось в матке у 38% и во влагалище у 44,3% пациенток, включенных в программу ЭКО, в матке у 73,9% и во влагалище у 73,9% пациенток, не включенных в программу ЭКО, в матке у 85,7% и во влагалище у 85,7% здоровых женщин. Микробиом представлен родами Gardnerella, Streptococcus, Atopobium, Bifidobacterium, Sneathia, Prevotella и Staphylococcus. В течение исследования у 15 пациенток получена беременность после переноса одной размороженной бластоцисты. У пациенток с беременностью среднее число лактобацилл в микробиоме матки составляло 96,45±33,61% [28]. Та же группа исследователей сообщила о попытке клинического применения данных, полученных при исследовании микробиома полости матки. Из 92 пациенток с предыдущими неудачными попытками ЭКО/ИКСИ у 47 (51,1%) обнаружено доминирование в микробиоме лактобацилл (более 90% бактерий рода Lactobacillus) и у 45 (48,9%) — отсутствие такого доминирования. Из 45 пациенток без доминирования 9 назначены антибиотики (амоксициллин 750 мг/сут или левофлоксацин 500 мг/сут в течение недели), после этого — препараты лактоферрина 300 мг/сут, а также пробиотики в виде вагинальных тампонов и свечей в течение 1 мес. У всех пациенток при повторном анализе наблюдалось доминирование лактобацилл. После этого проведены переносы размороженных бластоцист. У 56 пациенток с доминированием лактобацилл проведен 91 перенос и получено 33 беременности (частота беременности составила 58,9% на 1 пациентку), у 36 пациенток без доминирования лактобацилл проведено 49 переносов и получено 17 беременностей (частота наступления беременности составила 47,2% на 1 пациентку), различия статистически незначимые [29].

Проведено исследование, в котором сравнивали микробиомы содержимого полости матки и биоптатов эндометрия у 25 пациенток с привычным невынашиванием беременности. Отмечено, что некоторые виды бактерий выявлены в биоптате эндометрия, но не обнаружены в полости матки. К ним относятся бактерии родов Verrucomicrobiaceae, Brevundimonas, Achromobacter, Exiguobacterium и Flavobacterium. Таким образом, существуют значительные различия между микробиомом полости матки и поверхности эндометрия [30].

Вероятность влияния хронического эндометрита на частоту наступления беременности при лечении бесплодия в программах ЭКО/ИКСИ вызывает многочисленные споры. Предпринята попытка исследовать эту проблему с привлечением данных о микробиоме эндометрия. С этой целью в исследование включены 113 пациенток с бесплодием, у которых диагноз хронического эндометрита подтвержден с помощью иммуногистохимического исследования эндометрия на основании наличия маркера CD138. Диагностика бактериального возбудителя хронического эндометрита проведена методом ПЦР в реальном времени для видов Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma Parvum, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis и Klebsiella pneumoniae. Для диагностики видов Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae и Streptococcus mitis применены методы культивирования. Для диагностики хронического эндометрита использованы гистероскопия, классическое гистологическое исследование и изучение микробиома содержимого полости матки. Выявлен низкий уровень соответствия между различными методами диагностики хронического эндометрита, однако при сравнении результатов ПЦР и исследования микробиома конкордантные данные получены в 91,7% случаев, при сравнении результатов культивирования и исследования микробиома — в 75% случаев [31]. При раке эндометрия значительно изменяется микробиом полости матки по сравнению с таковым при доброкачественных заболеваниях и гиперплазии эндометрия. Выявлено, что при раке эндометрия доминирующими являются бактерии родов Bacteroides и Faecalibacterium, а также чаще встречаются бактерии типов Firmicutes, Spirochaetes, Actinobacteria, Bacteroidetes и Proteobacteria. Присутствие видов Atopobium vaginae и Porphyromonas somera может служить маркером наличия рака эндометрия. Кроме того, показано, что это заболевание ассоциировано с высоким уровнем рН во влагалище [32].

Предпринята попытка составить последовательность микробиома женской репродуктивной системы, начиная с нижней части влагалища и заканчивая задним сводом. Обнаружено, что лактобациллы составляют 99,97% от всех микробов в нижней части влагалища, 99,99% — в верхней части влагалища, тогда как в цервикальном канале — 97,56%. Первый микробиом, характеризующийся разнообразием видов, обнаружен в полости матки. Бактерии рода Lactobacillus составляют 30,6%, рода Pseudomonas 9,1%, Acinetobacter — 9,1%, Vagococcus — 7,3%, Sphingobium — 5%, семейство Comamonadaceae — 4,9%, рода Arthrobacter — 3,9%, Dysgonomonas — 3,7%, Shewanella — 3,4%, семейство Pseudomonadaceae — 2,9%, рода Delftia — 2,4%, семейство Tissierellaceae — 2,1%, рода Sphingomonas — 2,0%, семейство Erysipelotrichaceae — 1,6%, рода Erysipelothrix — 1,1%, на другие виды бактерий приходится около 11% микробиома. В маточной трубе доминирование лактобацилл заканчивается, чаще всего встречаются бактерии рода Acinetobacter — 18,3%, рода Comamonas — 11,5%, Pseudomonas — 9,9%, семейства Pseudomonadaceae — 9,1%, рода Dysgonomonas — 5,1%, рода Vagococcus — 4,8%, семейства Comamonadaceae — 3,9%, рода Delftia — 3,6%, Arthrobacter — 3,3%, Sphingobium — 3,1%, Shewanella — 1,8%, Sphingomonas — 1,8%, Facklamia — 1,8%, Stenotrophomonas — 1,7%, Lactobacillus — 1,7%, семейства Erysipelotrichaceae — 1,6%, семейства Tissierellaceae — 1,2%, семейства Micrococcaceae — 1,2%, рода Staphylococcus — 1,1%, вида Oxalobacte raceae — 1,1%, рода Erysipelothrix — 1,1%, вида Ochrobactrum — 1%, рода Achromobacter — 1%; другие бактерии составляют 9,2% от микробиома. В заднем своде чаще встречаются бактерии рода Pseudomonas и составляют 13,5% от микробиома, рода Vagococcus — 13,3%, Acinetobacter — 11,7%, Sphingobium — 5,8%, семейства Comamonadaceae — 5,7%, рода Shewanella — 5,6%, Dysgonomonas — 5,5%, Delftia — 5,1%, семейства Tissierellaceae — 3,9%, семейства Pseudomonadaceae — 3,9%, рода Arthrobacter — 3,8%, семейства Erysipelotrichaceae — 3,0%, рода Sphingomonas — 2%, рода Erysipelothrix — 1,6%, и на долю других бактерий приходится 15,5% от микробиома [33].

Доказано, что в периоде внутриутробного развития происходит контакт между плодом и микробами материнского организма. В плаценте микробы представлены в основном видом E. coli, а также родами Bacteroidetes, Firmicutes, Fusobacteria, Proteobacteria phyla и редко встречающимся Tenericutes. Наличие бактерий из рода Burkholderia ассоциируется с преждевременным созреванием плаценты, а микробов из рода Paenibacillus — с нормальными родами. Очень интересной находкой было то, что микробиом плаценты похож на микробиом ротовой полости, включая виды Prevotella tannerae и Neisseria [34]. Более того, высказано предположение о возможном механизме переселения микробов из ротовой полости и о том, что при гингивите и пародонтозе чаще наблюдаются осложнения беременности. У беременных в ротовой полости и в субгингивальном пространстве повышается число патогенных бактерий видов Aggregatibacter actinomycetemcomitans и Porphyromonas gingivalis, что может увеличить риск проникновения бактерий в плаценту [35]. В амниотический жидкости, как и в плаценте, микробы представлены малым количеством и разнообразием видов, преимущественно семейством Enterobacteriaceae, в основном родами Enterobacter и Escherichia/Shigella. Найдены также лактобациллы и бактерии родов Propionibacterium, Staphylococcus и Streptococcus. Выявлена колонизация микробами пуповины, и они представлены родами Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Propionibacterium [36]. Изучение микробиома мекония показало, что заселение микробами кишечника новорожденного происходит до рождения, виды микробов кишечника матери и мекония ребенка совпадают, и эти микробы активно участвуют в дальнейшем заселении кишечника и в становлении иммунитета новорожденного. Микробы мекония представлены родами Streptococcus, семейством Enterobacteriaceae (в основном родами Enterobacter и Escherichia), Lactobacillus и Propionibacterium) [37].

Понимание особенностей микробиома репродуктивной системы человека с точки зрения последовательности сообществ микробов от семенной жидкости до микробиома кишечника новорожденного может иметь большое клиническое значение.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

The authors declare no conflict of interest.

Сведения об авторах

Боярский К.Ю. — к.м.н., доцент кафедры акушерства и гинекологии им. С.Н.Давыдова, ФГБОУВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова»; https://orcid.org.0000-0002-2000-1567;

Кахиани Е.И. — д.м.н., профессор, заведующая кафедрой акушерства и гинекологии с курсом детской гинекологии, ФГБОУВО «Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет»; https://orcid.org.000-0002-0410-817Х

КАК ЦИТИРОВАТЬ:

Боярский К.Ю., Кахиани Е.И. Микробиом репродуктивной системы человека. Проблемы репродукции. 2019;25(4):-34. https://doi.org/10.17116/repro201925041

Автор, ответственный за переписку: Боярский К.Ю. —
e-mail: konstantinboyarsky@cloud.com