Изучены результаты аутопсий, проведенных в патолого-анатомическом отделении инфекционной больницы им. С.П. Боткина во время блокады Ленинграда (с 8 сентября 1941 по 27 января 1944 г.). Проанализированы данные 855 протоколов вскрытий умерших мирных жителей. Структура заболеваний умерших различалась в разные периоды блокады Ленинграда. В I периоде (сентябрь—декабрь 1941 г.) среди заболеваний превалировали дифтерия, дизентерия, корь, брюшной тиф, скарлатина. Наиболее частыми причинами смерти во II периоде (апрель—декабрь 1942 г.) явились сыпной тиф, дизентерия, туберкулез, крупозная пневмония, брюшной тиф. Нозологическая структура в III периоде блокады (январь 1943 г. — январь 1944 г.): туберкулез, дизентерия, истощение, крупозная пневмония, инфекционная желтуха. Расхождение клинического и морфологического диагнозов наиболее часто отмечено по следующим нозологиям: туберкулез легких, брюшной тиф, пневмония, рак желудка и гепатопанкреатобилиарной зоны, корь, грипп. Первый период блокады отличался высокой удельной долей исследования тел детей — 51,2% от всех аутопсий; в последующие периоды увеличилась до 76,2% удельная доля аутопсий умерших зрелого возраста (20—59 лет). Различие нозологической структуры и возрастных групп умерших в разные периоды блокады Ленинграда обусловливалось эпидемиологической обстановкой в городе, социально-бытовыми условиями и медико-организационными факторами. Проводившиеся в патолого-анатомическом отделении больницы им. С.П. Боткина во время блокады Ленинграда патоморфологические исследования позволяли своевременно устанавливать причины наступления летальных исходов и выявлять особенности течения инфекционных заболеваний на фоне истощения. Регулярно проводившиеся клинико-анатомические конференции способствовали редуцированию дефектов диагностики и лечения инфекционных заболеваний.