Борьба с туберкулезом (ТБ) продолжается во всем мире. Возбудителем ТБ являются медленнорастущие бактерии Mycobacterium tuberculosis complex (МБТ), которые нужно быстро и эффективно выявлять для своевременного назначения больному терапии. Для этого используют быстрые и высокочувствительные молекулярно-генетические методы на основе амплификации нуклеиновых кислот, в частности полимеразную цепную реакцию (ПЦР). В настоящее время переходят на более ускоренные методы, например изотермическую петлевую амплификацию (LAMP), на основе которой был разработан новый отечественный набор реагентов «АмплиТест МБТ-LAMP» для выявления ДНК M. tuberculosis complex in vitro (в ФГБУ «ЦСП» ФМБА России).
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ
Оценить эффективность нового набора на основе изотермической амплификации «АмплиТест МБТ-LAMP» при исследовании биологического материала и бактериальных культур в дорегистрационных клинических испытаниях в сравнении с референсным тестом (набором сравнения), аналогичным по назначению и зарегистрированным в РФ в качестве медицинского изделия.
МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
Анализировали 471 образец биологического материала от пациентов с ТБ легких и внелегочной локализации (мокрота (n=110), бронхоальвеолярный лаваж (n=110), моча (n=106), биоптат (операционный материал (n=145)) и 100 образцов бактериальных культур. Образцы, за исключением культур, предварительно обрабатывали методом NALC-NaOH [1], полученный осадок делили на 5 равных частей и анализировали с использованием 4 форм комплектации набора «АмплиТест МБТ-LAMP» и набора сравнения «АмплиТест МБТ». Для амплификации использовали приборы: Rotor-Gene 6000, CFX96, ДТпрайм, QuantStudio 5, ПО для автоматического учета результатов. Вычисляли по формулам показатели эффективности набора «АмплиТест МБТ-LAMP» (положительное соответствие результатов (ПСР) и отрицательное соответствие результатов (ОСР)) (с 95% доверительным интервалом (ДИ)).
РЕЗУЛЬТАТЫ
Результаты для всех образцов совпали при использовании нового набора и референсного теста. Дискордантных результатов не выявлено. Показатели эффективности (ПСР и ОСР) нового набора равны 100%.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Полученные результаты демонстрируют высокую эффективность нового набора реагентов «АмплиТест МБТ-LAMP», который можно использовать для быстрого выявления ДНК МБТ с целью назначения больному своевременной противотуберекулезной терапии и для отбора проб ДНК МБТ в концентрациях, требуемых для анализа с помощью наборов марки «АмплиТест» для выявления генетических маркеров резистентности МБТ к рифампицину и изониазиду.