ВВЕДЕНИЕ

Стратегия коррекции состава кишечной микробиоты демонстрирует значительные перспективы для лечения заболеваний желудочно-кишечного тракта. Существует подтвержденная связь между состоянием микробиоты толстой кишки и человеческими патологиями. Обезьяны, макаки резусы, признаны наилучшей животной моделью для изучения механизмов, влияющих на развитие острого и хронического воспаления. Схожесть ключевых анатомических и физиологических систем у макак и человека обеспечивает значительные преимущества при проведении биомедицинских исследований на этих животных для оценки безопасности и эффективности разрабатываемых микробных препаратов медицинского назначения, предлагаемых для нормализации кишечного микробиоценоза.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Анализ таксономического состава кишечной микробиоты макак резусов различного возраста, содержащихся в условиях неволи.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

В исследование включены 17 образцов фекалий, отобранных от клинически здоровых особей макак резусов, содержащихся в неволе. ДНК выделяли из образцов фекалий с помощью MagMAX Microbiome Ultra Nucleic Acid Isolation Kit. Образцы анализировали метагеномным секвенированием региона V3-V4 гена 16S рРНК.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Анализ данных 16S рРНК метагеномного секвенирования показал, что в кишечной микробиоте макак резусов доминируют бактерии отделов Firmicutes, Bacteriodetes и Actinobacteriota, которые также являются доминирующими у людей, и их соотношение изменяется в разных возрастных группах. С возрастом наблюдалось снижение представленности Actinobacteriota и соотношения Firmicutes/Bacteriodetes. Альфа разнообразие микробиоты кишечника разных возрастных групп макак резусов статистически не различалось, в то же время наибольшие абсолютные значения альфа разнообразия наблюдались в группе молодых особей. Анализ дифференциальной представленности показал, что микробиота кишечника молодых особей обогащена бутират-продуцирующими бактериями, что указывает на отсутствие нарушений состояния местного иммунитета кишечника. Старые особи демонстрируют повышенное содержание Streptococcus и Lachnospiraceae, которые можно интерпретировать как маркеры воспаления, что отражает возрастные особенности микробиоты кишечника обезьян.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Микробиота кишечника макак резусов различна в разных возрастных группах, при этом вариации внутри групп детенышей и молодых меньше, чем в группе старых особей.

Результаты проведенного секвенирования микробиоты кишечника обезьян продемонстрировали сходство ее состава с микробиотой кишечника человека, особенности возрастных изменений таксономического состава кишечной микробиоты макак резусов, что в определенной степени позволяет их использовать в качестве модели для изучения возрастной динамики кишечной микробиоты человека, перспективно для проведения возрастных исследований различных веществ, композиций и других факторов воздействия на организм человека, потенциально способных положительно или отрицательно влиять на его микробиоту.