ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ
Выявление комплексных генетических предикторов рассеянного склероза (РС) с использованием ранее установленных в полногеномных ассоциативных исследованиях маркеров заболевания (GWAS-маркеров) в популяции больных РС и здоровых лиц Республики Башкортостан (Российская Федерация) при помощи полигенного подхода.
МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
Общая группа исследования составила 2048 человек (641 пациент с РС и 1407 здоровых лиц), которые постоянно проживали в Республике Башкортостан и принадлежали к башкирской (n=325), русской (n=772) или татарской (n=951) национальностям. Выполнен анализ ассоциаций с РС полиморфных вариантов, ранее ассоциированных с заболеванием по данным GWAS. Из 641 пациента с РС 247 были объектом 20-летнего проспективного клинического наблюдения.
РЕЗУЛЬТАТЫ
В результате проведенного анализа установлено, что аллель C6orf10 rs3129934*T наиболее значимо ассоциирована с РС в группе русских (отношение шансов (ОШ)=2,00, P=5,85·10–5) и татар (ОШ=2,38, P=8,61·10–7). Повышенный риск заболевания у русских также связан с аллелями EOMES rs11129295*T (ОШ=1,56, P=0,007) и IL7R rs1494558*I (ОШ=1,61, P=0,003). При проведении метаанализа была подтверждена ассоциация аллелей C6orf10 rs3129934*T, EOMES rs11129295*T и IL7R rs1494558*I с РС в исследуемой группе, а также выявлены ассоциации аллелей INAVA rs7522462*G, IL7R rs10624573*I, CD6 rs17824933*G, GPC5 rs9523762*A и GPR65 rs2119704*C с заболеванием. При помощи полигенного анализа был идентифицирован комплексный предиктор C6orf10 rs3129934*C + INAVA rs7522462*G + CD6 rs17824933*C, обладающий выраженным протективным действием в отношении РС в общей группе исследования (ОШ=0,34, PFDR=2,65·10–7).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Нам удалось воспроизвести ассоциации между РС и 8 генетическими вариантами (C6orf10 rs3129934, INAVA rs7522462, IL7R rs10624573, EOMES rs11129295, GPR65 rs2119704, GPC5 rs9523762, CD6 rs17824933 и CD58 rs2300747), ранее выявленными в GWAS европейских популяций. В дальнейшем проведение полноэкзомного или полногеномного секвенирования может помочь раскрыть механизмы, лежащие в основе патогенеза РС в популяциях России.