Сайт издательства «Медиа Сфера»
содержит материалы, предназначенные исключительно для работников здравоохранения. Закрывая это сообщение, Вы подтверждаете, что являетесь дипломированным медицинским работником или студентом медицинского образовательного учреждения.

Слиман Я.А.

ФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России;
Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)

Самойленкова Н.С.

ФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России

Антипова О.М.

ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова»

Брылев В.А.

ФГБУН «Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук»

Верютин Д.А.

ФГБУН «Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук»

Сапожникова К.А.

ФГБУН «Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук»

Алексеева А.И.

Научно-исследовательский институт морфологии человека им. акад. А.П. Авцына ФГБНУ «Российский научный центр хирургии им. акад. Б.В. Петровского»;
ФГБУН «Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии Российской академии наук»

Пронин И.Н.

ФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России

Копылов А.М.

ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова»

Павлова Г.В.

ФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России;
ФГБУН «Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии Российской академии наук»;
ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет)

Ковалентно конъюгированный ДНК-аптамер с доксорубицином как in vitro модель эффективного адресного воздействия на опухолевые клетки глиобластомы человека

Авторы:

Слиман Я.А., Самойленкова Н.С., Антипова О.М., Брылев В.А., Верютин Д.А., Сапожникова К.А., Алексеева А.И., Пронин И.Н., Копылов А.М., Павлова Г.В.

Подробнее об авторах

Просмотров: 1153

Загрузок: 58


Как цитировать:

Слиман Я.А., Самойленкова Н.С., Антипова О.М., и др. Ковалентно конъюгированный ДНК-аптамер с доксорубицином как in vitro модель эффективного адресного воздействия на опухолевые клетки глиобластомы человека. Журнал «Вопросы нейрохирургии» имени Н.Н. Бурденко. 2024;88(1):48‑55.
Sliman YaA, Samoylenkova NS, Antipova OM, et al. Covalently conjugated DNA aptamer with doxorubicin as in vitro model for effective targeted drug delivery to human glioblastoma tumor cells. Burdenko's Journal of Neurosurgery. 2024;88(1):48‑55. (In Russ., In Engl.)
https://doi.org/10.17116/neiro20248801148

Рекомендуем статьи по данной теме:
Вы­бор ре­жи­ма фрак­ци­они­ро­ва­ния при гли­омах IV сте­пе­ни зло­ка­чес­твен­нос­ти в за­ви­си­мос­ти от быс­тро­го ран­не­го прог­рес­си­ро­ва­ния (REP). Жур­нал «Воп­ро­сы ней­ро­хи­рур­гии» име­ни Н.Н. Бур­ден­ко. 2024;(5):23-29
Но­вая тка­не­вая мо­дель гли­об­лас­то­мы 101.8 в эк­спе­ри­мен­тах на кры­сах: срав­ни­тель­ное ПЭТ-КТ-ис­сле­до­ва­ние с кле­точ­ной ли­ни­ей гли­об­лас­то­мы C6. Жур­нал «Воп­ро­сы ней­ро­хи­рур­гии» име­ни Н.Н. Бур­ден­ко. 2024;(6):54-62
Сов­ре­мен­ные под­хо­ды к изу­че­нию мо­ле­ку­ляр­ных ме­ха­низ­мов фун­кци­они­ро­ва­ния лег­ких в нор­ме и при па­то­ло­гии. Ар­хив па­то­ло­гии. 2024;(2):58-64
Па­ци­ен­ты с дли­тель­ной вы­жи­ва­емос­тью при зло­ка­чес­твен­ных гли­омах пос­ле фо­то­ди­на­ми­чес­кой те­ра­пии. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):54-61
Ран­няя хи­ми­оте­ра­пия меж­ду хи­рур­ги­чес­ким вме­ша­тельством и лу­че­вой те­ра­пи­ей при гли­омах 4-й сте­пе­ни зло­ка­чес­твен­нос­ти. Он­ко­ло­гия. Жур­нал им. П.А. Гер­це­на. 2024;(5):12-17
Ан­ти­ген­ные ре­цеп­то­ры в раз­ра­бот­ке CAR-T кле­ток для им­му­но­те­ра­пии гли­об­лас­то­мы. Он­ко­ло­гия. Жур­нал им. П.А. Гер­це­на. 2024;(6):91-95

Список сокращений

ГБ — глиобластома

EGFR — рецептор эпидермального фактора роста

ГЭБ — гематоэнцефалический барьер

DOX — доксорубицин

DOX-GR20 — ковалентный конъюгат аптамера GR20 с доксорубицином

MTS-тест — колориметрический тест для оценки метаболической активности клеток

ВЭЖХ — высокоэффективная жидкостная хроматография

Введение

Глиомы представляют собой гетерогенные первичные злокачественные опухоли головного мозга. Глиобластома (ГБ) является наиболее агрессивной формой глиомы, на которую приходится 70—75% всех глиом, а медиана общей выживаемости без лечения составляет 14—17 мес [1]. Несмотря на значительный прогресс в знаниях о развитии и лечении опухоли за последние несколько лет, прогноз остается неблагоприятным, в том числе из-за сложности целевой доставки существующих лекарств для химиотерапии или потенциальных противоопухолевых молекул к клеткам ГБ. Для разработки более эффективных методов лечения необходимо понимание патогенеза данного заболевания. Одну из ключевых ролей в нем играет рецептор эпидермального фактора роста EGFR — трансмембранный белок, представляющий собой рецепторную тирозинкиназу, сверхэкспрессирующуюся во многих типах клеток с высокой пролиферативной активностью, в частности при агрессивных формах рака, таких как немелкоклеточный рак легкого и глиома [2]. Запуск каскада при взаимодействии лиганда с EGFR модулирует клеточный рост, выживание, адгезию, миграцию и дифференцировку, что делает данную молекулу перспективной мишенью в противоопухолевой терапии [3].

Таким образом, одним из важнейших направлений в вопросах лечения является разработка системы адресной доставки лекарств, способной преодолевать гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) и целенаправленно воздействовать на опухоль. Такие молекулы, как аптамеры, могут эффективно распознавать различные белки на клеточной мембране или в кровотоке, модулировать их взаимодействие с рецепторами и воздействовать на соответствующие биологические пути для лечения различных заболеваний [4, 5]. Аптамеры обладают многими характеристиками, которые делают их идеальными терапевтическими агентами для лечения ГБ. Они представляют собой короткие одноцепочечные нуклеиновые кислоты (РНК или ДНК), способные связываться с молекулярной мишенью с высокой аффинностью и специфичностью. Было разработано несколько аптамеров, нацеленных на ГБ, для визуализации, выделения опухолевых клеток из биопсий и доставки лекарств/противоопухолевых молекул в опухолевые клетки. Благодаря своим свойствам (низкой иммуногенности, длительной стабильности и отсутствию токсичности) большое количество аптамеров было отобрано против биомаркеров ГБ и протестировано на клеточных линиях ГБ. Некоторые из них также были протестированы на моделях ГБ in vivo и потенциально рассматриваются как новые диагностические и/или терапевтические инструменты для лечения пациентов с ГБ [6]. За последние несколько десятилетий количество терапевтических аптамеров на различных стадиях клинических исследований увеличилось [5—7]. Помимо того, что они являются терапевтическими агентами, аптамеры широко исследовались в качестве целевых носителей для доставки других лекарственных препаратов. К различным биомаркерам, связанным с онкологическими заболеваниями, были разработаны конъюгаты аптамер-лекарство для широкого спектра терапевтических методов, таких как химиотерапия, иммунотерапия и т.д. [5—8]. Химиотерапия является одним из самых распространенных традиционных подходов к лечению рака, но при этом хорошо известно значительное количество побочных эффектов и негативное влияние на здоровые ткани организма за счет высокой токсичности существующих препаратов. Для повышения терапевтической эффективности и уменьшения побочных эффектов и ведутся разработки адресной доставки лекарств посредством использования конъюгатов аптамер-лекарство.

В качестве молекулы, вызывающей гибель опухолевых клеток, для пилотных исследований нами был выбран доксорубицин. Доксорубицин (DOX) — антрациклиновый антибиотик, выделенный из видов Streptomyces peucetius, который широко используется для лечения различных злокачественных внецеребральных новообразований [9]. Однако в терапии глиом он не используется, так как плохо доставляется в мозг человека. Доксорубицин может встраиваться в пары оснований двойной спирали ДНК (дцДНК), а также связываться с ферментами, расщепляющими ДНК, что в конечном итоге приводит к ее повреждению и в результате — к апоптозу в раковых клетках за счет ингибирования клеточного цикла. Как и другие химиопрепараты, доксорубицин обладает различными побочными эффектами, включая снижение количества лейкоцитов и эритроцитов или дозозависимую кардиотоксичность [9]. Важно отметить, что благодаря наличию плоских ароматических колец доксорубицин может непосредственно встраиваться в двухцепочечную ДНК. Используя свойства тушения флюоресценции, было подтверждено, что аптамеры и доксорубицин могут образовывать физический комплекс после инкубации. Недавно с использованием этого метода было синтезировано несколько конъюгатов аптамер-DOX. Например, H. Liu и соавт. и H. Hu и соавт. сконструировали конъюгаты аптамер-DOX, которые могут специфически распознавать и доставлять доксорубицин в HER-2- и MUC-1-положительные опухолевые клетки, вызывая их гибель [10]. A. Zhu и соавт. синтезировали биспецифический аптамер, названный SD и сконструированный из двух модифицированных одновалентных аптамеров sgc8c и sgd5a. Конъюгат этого аптамера с Dox способен распознавать различные типы клеток в клеточной смеси, указывая на то, что аптамеры могут эффективно доставлять цитотоксические агенты к разным популяциям клеток в гетерогенных опухолях [11]. Таким образом, конъюгат/комплекс может решить проблему таргетной доставки в опухолевую ткань головного мозга.

В работе исследовали эффективность терапевтического воздействия in vitro ковалентного конъюгата ДНК-аптамера GR20, чьей мишенью является EGFR [12, 13], и химиопрепарата доксорубицина на опухолевые клетки глиобластомы в сравнении с его воздействием на референсную культуру — фибробласты человека.

Материал и методы

Общий метод медь-катализируемой реакции азид-алкинового циклоприсоединения

Олигонуклеотиды собирали в ДНК-синтезаторе АСМ-2000 фосфорамидитным методом согласно рекомендациям производителя. Защищенные 2’-дезоксирибонуклеозид-3’-фосфорамидиты, Unylinker-CPG (1000 Å), были приобретены у «ChemGenes»; 5’-алкинфосфорамидит и аминомодифицированный CPG (1000 Å) были получены от «Lumiprobe LLC». Олигонуклеотиды обрабатывали 10% диэтиламином в MeCN, отщепляли от носителя и снимали защиту с помощью АМА – 1:1 (по объему) конц. водный аммиак и 40% водн. метиламина в течение 20 мин при 65 °C.

В пробирки объемом 2 мл с алкин-модифицированными олигонуклеотидами (50 нмоль) добавляли предварительно дегазированную деионизированную воду (15 мкл), 2М буфер TEAA (15 мкл), диметилсульфоксид (ДМСО) (57,5 мкл) и азид доксорубицина в ДМСО (5 мкл 10 мМ). Полученную смесь тщательно перемешивали. К реакционной смеси добавляли 10 мМ раствор премикса CuSO4∙5H2O–TBTA в 55% водн. ДМСО (15 мкл). Реакции запускали добавлением 10 мМ водн. аскорбиновой кислоты (37,5 мкл). Плотно закрытые пробирки выдерживали в темноте в течение 3 ч. Реакционные смеси осаждали 2% LiClO4 в ацетоне (1,8 мл) при –20°C в течение 1 ч. Центрифугировали при 10 000g, осадок промывали чистым ацетоном, подсушивали и растворили в 50% водном растворе формамида (100 мкл). Анализировали реакционные смеси методом электрофореза в денатурирующем 12% полиакриламидном геле (10×10 см, 8М мочевина, 1× буфер TBE), проводили в течение 30 мин при постоянном напряжении 350 В. Продукты разделяли электрофорезом в денатурирующем 12% полиакриламидном геле. Полосы, содержащие продукты клик-реакций, аккуратно вырезали скальпелем. Полученные срезы замораживали при –20 °C, измельчали и дважды элюировали деионизированной водой (всего 500 мкл). Элюаты обессоливали на колонках NAP-5 по стандартному протоколу.

Клеточные культуры

В эксперименте была использована перевиваемая культура клеток глиобластомы мозга человека Sus/fP2, полученная в 2014 г. из образца опухолевой ткани пациента, предоставленного НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко Минздрава России. В качестве контроля выступала линейная культура дермальных фибробластов (мезенхимные стволовые клетки) человека DF1, приобретенная в центре коллективного пользования «Коллекция культур клеток позвоночных» Института цитологии РАН (Санкт-Петербург).

Получение перевиваемых культур клеток

Образец опухоли, полученный от пациента, помещали в чашку Петри с холодным раствором Хенкса («Gibko», США) для очистки от кровеносных сосудов, оболочек, областей некроза при их наличии. Затем образец измельчали при помощи скальпеля и стеклянной пипеткой переносили в 15 мл пробирку. После осаждения всех фрагментов образца убирали раствор Хенкса и добавляли 0,25% раствор трипсина («Gibko», США). После повторного осаждения ткани отбирали трипсин и добавляли свежий, после чего помещали на подогреваемый до 37 °C шейкер до размягчения ткани, в среднем на это требуется около 20 мин. Чтобы остановить реакцию трипсина, в пробирку добавляли культуральную среду DMEM/F12 («Gibko», США) с добавлением 10% эмбриональной телячьей сыворотки («Gibko», США) в соотношении 1:1, после чего вновь ждали осаждения образца и отбирали жидкость, не захватывая осадок. Диссоциацию ткани проводили в холодном растворе Хенкса, добавляя его в пробирку и ресуспендируя ткань стеклянной пипеткой. После осаждения оставшихся крупных фрагментов взвесь образовавшихся клеток переносили в чистую пробирку. К оставшейся ткани вновь добавляли раствор Хенкса. Процесс диссоциации образца повторяли такое количество раз, которое требовалось для получения максимально возможного количества клеток. Взвесь клеток процеживали через нейлоновое ситечко для клеток с размером ячеек 40 мкм («Corning», США) в 50 мл пробирку для лучшего очищения от оставшихся крупных фрагментов и центрифугировали при 1000 об/мин в течение 10 мин. Отбирали жидкость, добавляли культуральную среду и рассевали на флаконы для дальнейшей культивации.

Культивирование клеток

Культивацию клеток проводили в ростовой среде DMEM/F12 с пируватом натрия с добавлением 10% эмбриональной телячьей сыворотки («Gibko», США), 1% раствора HEPES («Sigma», США) для поддержания pH, 1% GlutaMAX («Gibko», США) и 1% антибиотика/антимикотика (раствор пенициллина/стрептомицина/амфотерицина, «Gibko»). Флаконы с клетками помещали в CO2-инкубатор CB 150 («Binder», Германия), поддерживающий 5% уровень CO2 и температуру 37 °C. При пересеве клетки снимали 0,25% раствором трипсина («Gibko», США), добавляя 1 мл во флакон с клетками, отмытыми фосфатно-солевым буфером (PBS, «Gibko», США). Реакцию трипсина останавливали добавлением во флакон 1 мл ростовой среды. Клетки отбирали в пробирку и центрифугировали в течение 5 мин при 1000 об/мин. Жидкость убирали, добавляли свежей среды и в зависимости от задачи клетки пересевали в новые флаконы для дальнейшего культивирования или использовали в эксперименте.

MTS-тест

MTS-тест использовали для оценки антипролиферативной активности ковалентного конъюгата аптамера GR20 с антрациклиновым антибиотиком доксорубицином, обладающим антимитотическим и антипролиферативным действием. Клетки высевали на 96-луночные планшеты («Greiner», Австрия) по 3000 на лунку в 200 мкл ростовой среды DMEM/F12 и культивировали 48 ч при 37 °C во влажной атмосфере с 5% CO2. По истечении этого времени к клеткам первой группы добавляли по 100 мкл культуральной среды, содержащей предварительно префомированный (нагреваемый до 95° в течение 5 мин) раствор олигонуклеотида GR20 в концентрации 10 мкМ; к клеткам второй группы — по 100 мкл доксорубицина в одной из трех концентраций: 0,1; 0,5 или 1 мкМ; к клеткам третьей группы — по 100 мкл раствора конъюгата аптамера с доксорубицином также в концентрациях 0,1; 0,5 или 1 мкМ (соотношение молекул обоих веществ в конъюгате 1:1, концентрацию рассчитывали по доксорубицину как более токсичному соединению, входящему в состав комплекса). К клеткам контрольной группы вносили по 100 мкл среды, содержащей фосфатно-солевой буфер в соответствующей пропорции. В каждой группе использовали 5 повторов. В качестве бланка использовали лунки с ростовой средой.

Инкубацию с образцами при тех же условиях проводили еще 72 ч. После чего к 100 мкл ростовой среды вносили 20 мкл MTS-реагента («Promega», США). Через 2 ч измеряли оптическую плотность на мультимодальном ридере FLUOstar Omega («BMG Labtech», Германия) при длине волны λ=495 нм с использованием программы Omega-Control. Обсчет полученных результатов проводили при помощи программного обеспечения Omega-Data Analysis.

Измерение величины Клеточного индекса на клеточном анализаторе xCelligence S16

Исследование проводили на клеточном анализаторе xCelligence S16 («Agilent», США). Прибор способен оценивать жизнеспособность клеточных культур, регистрируя изменения в режиме реального времени без использования красителей и других дополнительных меток. Принцип работы основан на регистрации электрического сопротивления, которая происходит 1 раз в заданный промежуток времени, что позволяет получить график-функцию зависимости Клеточного индекса (Cell Index), параметра, характеризующего степень адгезии, на которую влияют жизнеспособность, морфология, пролиферативная способность клеток [14], от времени. Во время всего эксперимента прибор находится в CO2-инкубаторе и подсоединен к ноутбуку. Клетки рассевали по две лунки на группу на 16-луночный планшет E-plate. Всего было 4 экспериментальные группы для каждой культуры:

1. Контроль — клетки, к которым добавляли соответствующий объем деионизированной воды, полученной при помощи системы очистки Milli-Q, так как она являлась растворителем для большинства образцов;

2. GR20 — выступающий в качестве контроля аптамер GR20, используемый для создания конъюгата, в концентрации 10 мкМ;

3. DOX — нативный доксорубицин в концентрации 1 мкМ. Концентрация была выбрана в результате проведения многочисленных экспериментов с данным соединением как эффективно подавляющая процесс пролиферации/вызывающая гибель клеток;

4. DOX-GR20 — опытный образец — ковалентный конъюгат доксорубицина с аптамером GR20 в концентрации 1 мкМ.

Исходный уровень сопротивления измеряли, поместив в прибор планшет с заполненными средой лунками (basis). Клетки культур DF1 и Sus\fP2 рассевали на лунки по 6000 в объеме 200 мкл. После рассевания планшет помещали в анализатор и запускали программу для регистрации данных. Через 24 ч после высевания клеток на плашку, их адгезии и распространения по поверхности регистрацию останавливали, планшет вынимали из анализатора и добавляли растворы исследуемых веществ в объеме, необходимом для получения нужной концентрации, после чего возвращали планшет в прибор и запускали программу для регистрации происходящего в лунках еще в течение 3 сут, конечная точка регистрации соответствует таковой в MTS-тесте, когда анализ состояния клеток проводили через 72 ч после добавления соединений. Полный протокол эксперимента представлен в таблице. Регистрацию и анализ данных осуществляли при помощи программного обеспечения RTCA Software Lite.

Протокол эксперимента на клеточном анализаторе xCelligence S16

Seq

Auto

Step

Step Status

Sweep Status

Sweeps

Interval

Unit

Total Time

Comments

1

Step_1

DONE

1

1

1

minute

0:00:01

basis

2

Step_2

DONE

241

241

1

minute

4:19:05

3

*

Step_3

DONE

81

81

15

minute

24:27:45

4

Step_4

DONE

301

301

1

minute

29:38:45

compounds

5

*

Step_5

DONE

76

76

15

minute

48:30:31

6

Step_6

DONE

180

180

15

minute

93:14:09

Результаты

Получение конъюгата DOX-GR20

Конъюгат DOX-GR20 получали методом медь-катализируемой реакции азид-алкинового циклоприсоединения (рис. 1).

Рис. 1. Общая схема получения ковалентного конъюгата аптамер-доксорубицин.

Чистоту соединений DOX-GR20 определяли с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ), аналитического денатурирующего 14% электрофореза в полиакриламидный гель. ВЭЖХ проводили на приборе Agilent 1100 на колонке Waters xBridge 4,6×250 мм, линейный градиент от 5 до 50% MeCN в градиенте ацетата триэтиламмония от 0,1 до 0,02 М в течение 30 мин (рис. 2).

Рис. 2. Профиль ОФ-ВЭЖХ конъюгата GR20 с доксорубицином (детекция при 260 и 490 нм).

MTS-тест

При помощи MTS-теста оценивали результаты воздействия на дермальные фибробласты человека DF1 и клетки перевиваемой культуры ГБ мозга Sus/fP2 доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20. Результаты, полученные в MTS-тесте, представлены на гистограммах в виде процентного изменения уровня метаболической активности клеток, опосредованно свидетельствующего об изменениях уровня пролиферации, под воздействием исследуемых соединений по сравнению с контролем. Статистическую обработку данных проводили с использованием непараметрического критерия Манна—Уитни для оценки значимости наблюдаемых изменений.

На культуре дермальных фибробластов человека DF1 (рис. 3) не наблюдали влияния аптамера GR20 в концентрации 10 мкМ на метаболическую активность клеток. Использование чистого доксорубицина DOX привело к значимому дозозависимому уменьшению исследуемого параметра клеток на 13, 47 и 82% для концентраций 0,1, 0,5 и 1 мкМ соответственно. Конъюгат аптамера и доксорубицина DOX-GR20 значимо (на 19%) снизил метаболическую активность клеток только в концентрации 0,5 мкМ (p≤0,01). В концентрациях 0,1 и 1 мкМ отличий от контроля не наблюдали.

Рис. 3. Результаты воздействия на пролиферативную активность клеток дермальных фибробластов человека DF1 доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20 (конъюгат) по сравнению с контролем (интактными клетками). Оценка методом MTS-теста.

Анализ данных, полученных на культуре Sus/fP2 (рис. 4), показал незначительное, около 9%, снижение метаболической активности клеток под действием аптамера GR20, которое тем не менее статистически значимо отличается от контроля (p≤0,01). Добавление к клеткам доксорубицина привело к существенному дозозависимому снижению метаболической активности клеток на 27, 79 и 91% для концентраций 0,1, 0,5 и 1 мкМ соответственно. Под действием конъюгата аптамера и доксорубицина DOX-GR20 в концентрации 0,1 мкМ уровень метаболической активности клеток не отличался от контроля по данным статистической обработки. В то же время использование комплекса в концентрации 0,5 мкМ привело к снижению исследуемого параметра на 26% (p≤0,01). Однако в концентрации 1 мкМ наблюдали обратное действие комплекса. Метаболическая активность клеток повысилась почти на 30% по сравнению с контролем.

Рис. 4. Результаты воздействия на клеточную культуру глиобластомы человека Sus/fP2 доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20 (конъюгат). Оценка методом MTS-теста.

Клеточный анализатор xCelligence S16

Анализ MTS-тестом проводился в одной точке эксперимента, через 72 ч после воздействия. При этом следует помнить, что, хотя результаты MTS-теста обычно коррелируют с количеством жизнеспособных клеток, растущих в стандартных условиях культивирования, скорость восстановления тетразолия тем не менее отражает общую метаболическую активность в клеточной культуре, что делает этот метод не очень точным. В связи с этим мы применили дополнительный метод с использованием клеточного анализатора xCelligence S16, который позволяет оценивать пролиферативную активность клеток в течение длительного времени после воздействия антипролиферативными молекулами.

На рис. 5 представлены графики-функции зависимости Клеточного индекса от времени в культуре фибробластов DF1 с момента высевания клеток на плашку до окончания эксперимента. Видно, что в течение 24 ч перед добавлением исследуемых соединений, указанным красной стрелкой, рост клеток во всех группах был одинаков. В контрольной группе и группах, к которым добавляли аптамер GR20 и его конъюгат с доксорубицином, такая тенденция сохраняется на протяжении всей регистрации, что свидетельствует об отсутствии отрицательного влияния данных соединений на клетки культуры. В то же время под действием доксорубицина наблюдали стремительное убывание количества клеток. В течение 3 сут происходит падение величины Клеточного индекса практически до нулевого значения, что свидетельствует о почти полной гибели клеток.

Рис. 5. Зависимость клеточного индекса от времени на клетках референсной культуры дермальных фибробластов человека DF1 под действием доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20.

Красной стрелкой указано время добавления к клеткам исследуемых соединений.

Кроме того, программа обработки данных предоставляет возможность получить результат в виде гистограмм, демонстрирующих время, требующееся для удвоения или двукратного уменьшения клеточной популяции в экспериментальных группах. Таким образом, величина Клеточного индекса приобретает отображение в конкретных единицах измерения, а не представляет собой условный параметр, включающий многие характеристики культуры. На рис. 6 видно, что от момента добавления исследуемых соединений до окончания времени эксперимента клеткам контрольной группы требуется около 70 ч для удвоения своего количества. Схожие значения зарегистрированы в группах GR20 и DOX-GR20, что еще раз подтверждает отсутствие негативного влияния аптамера и его конъюгата. Под действием нативного доксорубицина наблюдаем быструю гибель клеток, время двукратного уменьшения их количества составляет 4,11 ч.

Рис. 6. Оценка времени, требующегося клеткам дермальных фибробластов человека DF1 для удвоения/двукратного уменьшения количества после добавления доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20.

Графики-функции зависимости Клеточного индекса от времени на перевиваемой культуре ГБ человека Sus/fP2 представлены на рис. 7. Как и на культуре DF1, до внесения в культуральную среду исследуемых веществ (доксорубицина (DOX)/аптамер GR20/конъюгат DOX-GR20), момент которого отмечен красной стрелкой, процесс пролиферации во всех группах шел с одинаковой скоростью. Далее в контрольной группе наблюдаем постепенный рост с выходом на плато. Добавление к клеткам аптамера GR20 приводит сначала к небольшому ускорению пролиферативного процесса, начинающему снижаться через 2 сут после внесения его в среду. Использование конъюгата DOX-GR20 также сначала активирует процесс пролиферации, однако через 1 сут после добавления комплекса наблюдаем начало процесса убывания количества клеток. Чистый доксорубицин в концентрации 1 мкМ практически сразу после добавления приводит к ускоряющейся гибели клеток, которая полностью завершается в течение эксперимента.

Рис. 7. График-функция зависимости Клеточного индекса от времени на клеточной культуре глиобластомы человека Sus/fP2 под действием доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20.

Красной стрелкой указано время добавления к клеткам исследуемых соединений.

В данном случае интересно рассмотреть, как менялась скорость пролиферации клеток культуры на разных этапах после добавления исследуемых соединений. Как видно на рис. 8, в 1-е сутки после добавления соединений клеткам контрольной группы требуется около 67 ч для удвоения своего количества. Под действием аптамера GR20 и его конъюгата прирост на этом этапе идет несколько быстрее, клеткам требуется в 1,4 и 1,9 раза меньше времени на этот процесс для каждой из групп соответственно. Доксорубицин вызывает убывание количества клеток с момента добавления, время двукратного уменьшения составляет менее 1 сут.

Рис. 8. Оценка времени, требующегося клеточной культуре глиобластомы человека Sus/fP2 для удвоения/двукратного уменьшения количества после добавления доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20 (во временном интервале 0—25 ч после воздействия).

В последние 2 сут эксперимента (рис. 9) наблюдаем значительное замедление процесса пролиферации в контрольной группе клеток, в это время происходит постепенный выход на плато. Удвоение количества клеток теперь занимает 757 ч. В то же время под действием аптамера GR20 на этом этапе начинается очень медленная убыль количества клеток. Для двукратного уменьшения требуется 684 ч. Намного быстрее происходит падение количества клеток в группе, к которой добавляли ковалентный конъюгат DOX-GR20. Время двукратного уменьшения составляет 53 ч. Под действием чистого доксорубицина в концентрации 1 мкМ за это время происходит полная гибель клеток.

Рис. 9. Оценка времени, требующегося клеточной культуре глиобластомы человека Sus/fP2 для удвоения/двукратного уменьшения количества после добавления доксорубицина (DOX), аптамера GR20 и конъюгата DOX-GR20 (во временном интервале 25—68 ч после воздействия).

Обсуждение

Исследования молекул-аптамеров не только как терапевтических агентов, но и как эффективных носителей для адресной доставки лекарственных препаратов в опухолевые клетки (что сводит к минимуму повреждение здоровых клеток), ведутся различными группами ученых [10, 11].

Проанализировав полученные с помощью двух разных методов данные, можно заключить, что аптамер к EGFR GR20 в концентрации 10 мкМ и его конъюгат с доксорубицином DOX-GR20 в концентрации 1 мкМ не оказывают негативного влияния на клетки контрольной культуры фибробластов DF1. И в MTS-тесте, и на клеточном анализаторе xCelligence S16 не было зарегистрировано снижения метаболической активности клеток и их способности к пролиферации по сравнению с контролем, а также наблюдалась практически полная гибель клеток под действием доксорубицина в концентрации 1 мкМ в течение 3 сут после начала его воздействия на культуру.

На перевиваемой культуре ГБ человека Sus/fP2 результаты, полученные обоими методами, согласуются не полностью. Конечная точка эксперимента на клеточном анализаторе соответствует моменту проведения MTS-теста. В обоих случаях через 72 ч после внесения в культуральную среду исследуемых соединений зафиксирована полная гибель клеток под действием доксорубицина в концентрации 1 мкМ. Снижение метаболической активности в 9% под действием аптамера GR20 в концентрации 10 мкМ в MTS-тесте совпадает с медленным убыванием количества клеток, зарегистрированным при помощи клеточного анализатора в последние сутки эксперимента. Что касается влияния ковалентного конъюгата DOX-GR20 в концентрации 1 мкМ, то наблюдаемое при его воздействии быстрое убывание клеток культуры на анализаторе xCelligence S16 не совпадает с результатом, полученным в MTS-тесте. Поскольку результаты последнего представляют собой оценку метаболической активности клеток и лишь косвенно свидетельствуют о влиянии на процесс пролиферации изучаемых соединений, можно предположить, что данные, полученные с клеточного анализатора, более релевантны. Таким образом, можно сделать вывод о незначительном влиянии аптамера GR20 на клетки перевиваемой культуры ГБ человека Sus/fP2 и существенном негативном воздействии его ковалентного конъюгата с доксорубицином.

Заключение

В результате эксперимента установлено наличие выраженного негативного влияния исследуемых соединений на перевиваемую культуру ГБ человека Sus/fP2 и практически полное отсутствие такового на клетки нормы — дермальные фибробласты DF1. Доксорубицин приводит к полной гибели клеток обеих культур. Важным результатом является то, что на опухолевых клетках ковалентный конъюгат доксорубицина с аптамером GR20 к EGFR осуществляет эффективную целевую доставку химиотерапевтического агента в клетки, что приводит к их ускоряющейся гибели, в отличие от результата, полученного на культуре DF1, где конъюгат не оказал на клетки никакого влияния по сравнению с контролем.

Участие авторов:

Концепция и дизайн исследования — Павлова Г.В., Самойленкова Н.С.

Сбор и обработка материала — Слиман Я.А., Самойленкова Н.С., Антипова О.М., Брылев В.А., Верютин Д.А., Сапожникова К.А., Алексеева А.И., Пронин И.Н., Копылов А.М., Павлова Г.В.

Статистическая обработка — Слиман Я.А., Самойленкова Н.С.

Написание текста — Слиман Я.А., Самойленкова Н.С., Павлова Г.В.

Редактирование — Павлова Г.В.

Работа выполнена при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (соглашение №075-15-2021-1343).

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Подтверждение e-mail

На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.

Подтверждение e-mail

Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.