Некоторые генетические маркеры, ассоциированные с тяжестью течения COVID-19 у человека

Закрыть метаданные

Рекомендуем статьи по данной теме:

Фармакогенетика агонистов глюкагоноподобного пептида-1 в лечении сахарного диабета 2-го типа. Профилактическая медицина. 2023;(12):95-100

Влияние генетических полиморфизмов на эффективность и безопасность ингибиторов натрий-глюкозного ко-транспортера 2-го типа в лечении сахарного диабета 2-го типа. Профилактическая медицина. 2024;(1):67-71

Роль полиморфизма rs148982377 гена ZNF789 в формировании бесплодия у больных эндометриозом. Проблемы репродукции. 2024;(1):64-71

Синдром гиперстимуляции яичников и внутрибрюшная гипертензия: систематический обзор. Анестезиология и реаниматология. 2024;(2):97-103

Прекондиционирование и посткондиционирование кислородно-гелиевыми смесями при ишемии миокарда. Кардиологический вестник. 2024;(2):5-12

Физическая реабилитация при саркопении: современные подходы. (Обзор литературы). Вопросы курортологии, физиотерапии и лечебной физической культуры. 2024;(3):56-61

Ассоциация воспаления и синдрома хронической усталости при болезни Паркинсона. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2024;(9):79-87

Полиморфные варианты в кластере генов, кодирующих рецепторы следовых аминов, и когнитивное функционирование у пациентов с расстройствами шизофренического спектра и здоровых. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2024;(9):122-128

ЦЕЛЬ СИСТЕМАТИЧЕСКОГО ОБЗОРА

Анализ ассоциации генетических маркеров с различными формами течения COVID-19 у человека.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

Для поиска литературы использованы поисковые системы eLIBRARY.RU — научная электронная библиотека и PubMed.gov. Условиями включения стали: возраст пациентов от 18 лет, положительный результат обнаружения нуклеиновой кислоты SARS-CoV-2 в образцах пациентов методом полимеразной цепной реакции с обратной транскриптазой, ранжирование пациентов по степеням тяжести течения инфекции COVID-19. В данном анализе рассмотрены только публикации последних 3 лет (2020—2022 гг.) и не включались клинические исследования препаратов, исследования, проведенные на животных, и обзоры литературы.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Анализ литературы за 2020—2022 гг. показал, что в большинстве случаев исследования направлены на изучение генетических маркеров вируса. Авторы делают акцент на поиске ассоциаций с тяжелым течением COVID-19. Остаются малозаметными бессимптомные случаи заболевания, которые также приводят к серьезным последствиям в социальной и экономической сфере общества ввиду распространения инфекции. В проанализированной литературе основная масса исследований направлена на изучение ассоциации степеней тяжести течения COVID-19 и вариантов нуклеотидной последовательности генов HLA, ACE2, TMPRSS2, LZTFL1. Данные гены являются перспективными для дальнейшего изучения, результаты которого могут внести большой вклад в стратификацию рисков, оптимизацию профилактики и разработку персонализированного лечения.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Анализ литературы позволяет нам включить генетические маркеры в факторы риска течения инфекции COVID-19. Однако современные исследования имеют ряд ограничений: небольшие размеры выборки, ограничение исследований только одной популяцией, разные интерпретации степеней тяжести.

Ключевые слова:

генетические маркеры

HLA

ACE2

TMPRSS2

LZTFL1

бессимптомное течение COVID-19

легкая степень тяжести COVID-19

средняя степень тяжести COVID-19

тяжелая степень тяжести COVID-19

мутация

полиморфизм

систематический обзор

Авторы:

Зорина В.В.

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины — филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» Минобрнауки России

ORCID: 0000-0002-7846-7933

Худякова А.Д.

ORCID: 0000-0001-7875-1566

Гарбузова Е.В.

ORCID: 0000-0001-5316-4664

Дата поступления:

08.06.2023

Дата принятия в печать:

22.09.2023

Список литературы:

Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). Готовность к чрезвычайным ситуациям, реагирование. Пневмония неизвестной этиологии — Китай (по состоянию на 12 сентября 2020 г.). Ссылка активна на 08.10.23. https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en
Zaim S, Chong JH, Sankaranarayanan V, Harky A. COVID-19 and multi-organ response. Current Problems in Cardiology. 2020;45(8):100618. https://doi.org/10.1016/j.cpcardiol.2020.100618
Chen Y, Wang AH, Yi B, et al. The epidemiological characteristics of infection in close contacts of COVID-19 in Ningbo city. Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi = Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi. 2020;41(5):667-671. https://doi.org/10.3760/cma.j.cn112338-20200304-00251
Камкин Е.Г., Костенко Н.А., Каракулина Е.В. Временные методические рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)», версия 6 (28.04.20). Ссылка активна на 08.10.23. https://base.garant.ru/73964533/?ysclid=lnlhahtyjz236274765
Martínez-Diz S, Marín-Benesiu F, López-Torres G, et al. Relevance of TMPRSS2, CD163/CD206, and CD33 in clinical severity stratification of COVID-19. Frontiers in Immunology. 2022;13:1094644. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.1094644
Колюбаева С.Н., Кондратенко А.А., Алхаже К. и др. Исследование полиморфизма генов HLA-DRB1 и IL28 у пациентов, перенесших новую коронавирусную инфекцию (COVID-19) различной степени тяжести. Гены и клетки. 2021;16(3):86-90. https://doi.org/10.23868/202110012
Choo SY. The HLA system: genetics, immunology, clinical testing, and clinical implications. Yonsei Medical Journal. 2007;48(1):11-23. https://doi.org/10.3349/ymj.2007.48.1.11
Mollica V, Rizzo A, Massari F. The pivotal role of TMPRSS2 in coronavirus disease 2019 and prostate cancer. Future Oncology. 2020;16(27): 2020-2033. https://doi.org/10.2217/fon-2020-0571
Qing E, Hantak MP, Galpalli GG, Gallagher T. Evaluating MERS-CoV entry pathways. Methods in Molecular Biology. 2020;2099:9-20. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0211-9_2
Datta PK, Liu F, Fischer T, et al. SARS-CoV-2 pandemic and research gaps: understanding SARS-CoV-2 interaction with the ACE2 receptor and implications for therapy. Theranostics. 2020;10:7448-7464. https://doi.org/10.7150/thno.48076
Hoffmann M, Kleine-Weber H, Schroeder S, et al. SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor. Cell. 2020;181(2): 271-280.e8. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.02.052
Seo S, Zhang Q, Bugge K, et al. A novel protein LZTFL1 regulates ciliary trafficking of the BBSome and Smoothened. PLoS Genetics. 2011;7(11): e1002358. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002358
Augusto DG, Yusufali T, Sabatino JJ Jr, et al. A common allele of HLA mediates asymptomatic SARS-CoV-2 infection. medRxiv. Preprint. 2021. https://doi.org/10.1101/2021.05.13.21257065
Naemi FMA, Al-Adwani S, Al-Khatabi H, Al-Nazawi A. Association between the HLA genotype and the severity of COVID-19 infection among South Asians. Journal of Medical Virology. 2021;93(7):4430-4437. https://doi.org/10.1002/jmv.27003
Ebrahimi S, Ghasemi-Basir HR, Majzoobi MM, et al. HLA-DRB1*04 may predict the severity of disease in a group of Iranian COVID-19 patients. Human Immunology. 2021;82(10): 719-725. https://doi.org/10.1016/j.humimm.2021.07.004
Farahani RH, Esmaeilzadeh E, Asl AN, et al. Frequency of HLA Alleles in a Group of Severe COVID-19 Iranian Patients. Iranian Journal of Public Health. 2021;50(9):1882-1886. https://doi.org/10.18502/ijph.v50i9.7061
Anzurez A, Naka I, Miki S, et al. Association of HLA-DRB1*09:01 with severe COVID-19. HLA. 2021;8(1):37-42. https://doi.org/10.1111/tan.14256
Langton DJ, Bourke SC, Lie BA, et al. The influence of HLA genotype on the severity of COVID-19 infection. HLA. 2021;98(1):14-22. https://doi.org/10.1111/tan.14284
Nhung VP, Ton ND, Ngoc TTB, et al. Host Genetic Risk Factors Associated with COVID-19 Susceptibility and Severity in Vietnamese. Genes. 2022; 13(10):1884. https://doi.org/10.3390/genes13101884
Rokni M, Heidari Nia M, Sarhadi M, et al. Association of TMPRSS2 Gene Polymorphisms with COVID-19 Severity and Mortality: A Case-Control Study with Computational Analyses. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2022; 194(8):3507-3526. https://doi.org/10.1007/s12010-022-03885-w
David A, Parkinson N, Peacock TP, et al. A common TMPRSS2 variant has a protective effect against severe COVID-19. Current Research in Translational Medicine. 2022;70(2):103333. https://doi.org/10.1016/j.retram.2022.103333
Abdelsattar S, Kasemy ZA, Ewida SF, et al. ACE2 and TMPRSS2 SNPs as Determinants of Susceptibility to, and Severity of, a COVID-19 Infection. British Journal of Biomedical Science. 2022;79:10238. https://doi.org/10.3389/bjbs.2021.10238
De Andrade CC, Silva ATP, Vasconcelos LRS, et al. A Polymorphism in the TMPRSS2 Gene Increases the Risk of Death in Older Patients Hospitalized with COVID-19. Viruses. 2022;14(11):2557. https://doi.org/10.3390/v14112557
Pandey RK, Srivastava A, Singh PP, Chaubey G. Genetic association of TMPRSS2 rs2070788 polymorphism with COVID-19 case fatality rate among Indian populations. Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. 2022;98:105206. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2022.105206
Martínez-Gómez LE, Herrera-López B, Martinez-Armenta C, et al. ACE and ACE2 Gene Variants Are Associated With Severe Outcomes of COVID-19 in Men. Frontiers in Immunology. 2022;13:812940. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.812940
Алибекова Г.Р.К., Мустафаев Н.Ш.О., Гусейнова И.М.К. Роль синергической связи АСЕ I/D и ACE2 G8790A полиморфизмов в этиологии COVID-19. Биологические науки. 2020:277-284.
Möhlendick B, Schönfelder K, Breuckmann K, et al. ACE2 polymorphism and susceptibility for SARS-CoV-2 infection and severity of COVID-19. Pharmacogenetics and Genomics. 2021;31(8):165-171. https://doi.org/10.1097/FPC.0000000000000436
Hamet P, Pausova Z, Attaoua R, et al. SARS-CoV-2 Receptor ACE2 Gene Is Associated with Hypertension and Severity of COVID 19: Interaction with Sex, Obesity, and Smoking. American Journal of Hypertension. 2021;34(4): 367-376. https://doi.org/10.1093/ajh/hpaa223
Кузнецова Е.В., Матиевская Н.В., Морозик П.М. и др. Ассоциация полиморфизмов генов, кодирующих ренин-ангиотензиновую систему, и гена LZTFL1 с тяжестью течения COVID-19. Гепатология и гастроэнтерология. 2022;6(2): 156-157.
Rüter J, Pallerla SR, Meyer CG, et al. Host genetic loci LZTFL1 and CCL2 associated with SARS-CoV-2 infection and severity of COVID-19. International Journal of Infectious Diseases: IJID. 2022;122:427-436. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2022.06.030
Downes DJ, Cross AR, Hua P, et al. Identification of LZTFL1 as a candidate effector gene at a COVID-19 risk locus. Nature Genetics. 2021;53(11): 1606-1615. https://doi.org/10.1038/s41588-021-00955-3

Закрыть метаданные