Исследование геномного разнообразия SARS-CoV-2 проведено во время снятия коронавирусных ограничений и открытия государственных границ России с другими странами.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Выявление геновариантов SARS-CoV-2 на территориях Свердловской, Челябинской областей и Пермского края.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

Методом секвенирования по Сэнгеру исследовано 1127 носоглоточных мазков больных новой коронавирусной инфекцией, находящихся на лечении в Свердловской, Челябинской областях и Пермском крае.

РЕЗУЛЬТАТЫ

В работе продемонстрирована динамика появления штаммов нового короновируса и нескольких мутаций за период с мая по декабрь 2022 г., проведена описательная статистика. В период проведения исследования наблюдалось превалирование варианта Omicron (~97%), содержащего по сравнению с вариантами Delta и Alpha большее количество мутаций, приводящих к замене аминокислот. Субвариант Omicron BA.2 преобладал в период исследования с мая по сентябрь, затем с октября по декабрь 2022 г., субварианты BA.4/BA.5 вытеснили BA.2.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Анализ молекулярного состава вариантов SARS-CoV-2 показал присутствие нетипичных мутаций в некоторых образцах (E484K,G485R, R408I ), а также увеличение в числе мутаций у вариантов, в особенности в рецепторсвязывающем домене RBD. По данным литературы, аминокислотные замены приводят к изменению конформации S-белка, что, в свою очередь, повышает аффинность связывания RBD с ACE2 и влияет на более легкое течение заболевания и высокую контагиозность по сравнению с ранними вариантами SARS-CoV-2.